V portugalskom pútnickom mieste Fatime, s ktorým bol Svätý Otec veľmi spojený, sa v piatok 1. apríla 2005 slúžila svätá omša za pápeža Jána Pavla II., na ktorej sa zúčastnili tisíce veriacich. Svätý Otec navštívil Fatimu trikrát – v roku 1982 a 1991 - na poďakovanie za svoju záchranu pri atentáte, ako aj v roku 2000, keď tu blahorečil fatimských pastierikov vizionárov Jacintu a Františka Martových. V komuniké Rektorátu pútnického miesta sa uvádzalo: „Prežívame chvíle veľkej starosti pre utrpenie pápeža, ale aj viery a nádeje. Ján Pavol II. sa stal najvýznamnejším sprostredkovateľom posolstva z Fatimy ...“
Posledná fatimská vizionárka sr. Lucia dos Santos zomrela tohto roku vo februári vo veku 97 rokov. Ročne prichádzajú do Fatimy viac ako tri milióny pútnikov.