V piatok 26. mája 2006 priletel Benedikt XVI. vrtuľníkom z Čenstochovej do Krakova, mesta Ján Pavla II., svojho predchodcu. V Krakove Ján Pavol II. prežil štúdiá, kaplánske pôsobenie i 20 rokov biskupskej služby. Mesto vítalo nástupcu "svojho" pápeža veľmi srdečne, bolo vyzdobené vatikánskymi, poľskými, ale i nemeckými zástavami a cestu do arcibiskupského paláca lemovali tisíce prevažne mladých ľudí. Dvadsať tisíc sa ich zhromaždilo pred tzv. pápežským oknom. Z neho sa Ján Pavol II. spontánne prihovoril počas svojej návštevy, čo sa stalo tradíciou, tzv. stretnutie na dobrú noc.
Okolo desiatej hodiny večer, mladí skandovali, aby sa pápež ukázal v okne a prehovoril ku nim. Po niekoľkých minútach sa v okne objavil Benedikt XVI. a prehovoril po poľsky a taliansky. Potvrdil, že "pápež Ján Pavol II. je medzi nami, mladý v Bohu", pripomínajúc tým recept na mladosť, ktorý tu odovzdal mladým Ján Pavol II. v roku 2002.
Od smrti Ján Pavla II. sa tu mladí stretávajú modliť za pápeža. Benedikt XVI. sa im poďakoval za tieto modlitby a nepriamo odpovedal aj na otázku, ktorú očakáva celké Poľsko, kedy bude blahorečený Ján Pavol II. Mladým povedal: "Nech táto modlitba pomáha aj tým, ktorí pracujú na procese beatifikácie, vaše srdcia nech napĺňa mnohými milosťami". Aj po jeho odchode mladí dlho skandovali "Vitaj doma; ďakujeme, zostaň s nami" a zaspievali mu pieseň "Bárka".